Homology
It provides information about genetic similarity.
>Sample1|Human|H3N2|HA
CAAAAACTTCCCGGAAATGACAACAGCACAGCAACGCTGTGCCTGGGACATCATGCAGTGCCAAACGGAACGCTAGTGAAAACAATCACGAATGATCAGATTGAAGTGACTAATGCTACTGAGCTGGTTCAGAGTTCCTCAACAGGTAGAATATGCGACAGTCCTCACCGAATCCTTGATGGAAAAAACTGCACACTGATAGATGCTCTATTGGGAGACCCTCATTGTGATGGCTTCCAAAATGAGAAATGGGACCTTTTTGTTGAACGCAGCAAAGCTTACAGCAACTGTTACCCTTATGATGTGCCGGATTATGCCTCCCTTAGGTCACTAGTTGCCTCATCAGGCACCCTGGAGTTTATCAATGAAGACTTCAATTGGACTGGAGTCACTCAGAGTGGGGGAAGCTATACTTGCAAAAGGGGATCTGTTAACAGTTTCTTCAGTAGATTGAATTGGTTGTACGAATCAGAATACAAATATCCAGCGCTGAACGTGACTATGCCAAACAATGGCAAATTTGACAAATTGTACATTTGGGGGGTTCACCACCCGAGCACGGACAGAGAACAAACCAACCTATATGTTCGAGCATCAGGGAGAGTCACAGTCTCTACCAAGAGAAGCCAGCAAACTGTAATCCCGAATATCGGGTCTAGACCCTGGGTAAGGGGTCTGTCCAGTAGAATAAGCATCTATTGGACAATAGTAAAACCGGGAGACATACTGTTGATTAATAGCACCGGGAACCTAATTGCTCCTCGGGGTTACTTCAAAATACGCACTGGGAAAAGCTCAATAATGAGGTCAGATGCACCTATTGGCACCTGCAGCTCTGAATGCATCACTCCAAATGGAAGCATTCCCAATGACAAACCCTTTCAAAATGTAAACAAGATCACATATGGGGCATGTCCCAGGTATGTTAAGCAAAACACTCTGAAATTGGCAACAGGGATGCGGAATGTACCAGAGAAACAAACTAGA
>Sample2|Human|H3N2|HA
CAAAAACTTCCCGGAAATGACAACAGCACAGCAACGCTGTGCCTGGGACATCATGCAGTGCCAAACGGAACGCTAGTGAAAACAATCACGAATGATCAAATTGAAGTGACTAATGCTACTGAGCTGGTTCAGAGTTCCTCAACAGGTAGAATATGCGACAGTCCTCACCGAATCCTTGATGGAAAAAACTGCACACTGATAGATGCTCTATTGGGAGACCCTCATTGTGATGGCTTCCAAAATAAGGAATGGGACCTTTTTGTTGAACGCAGCAAAGCTTACAGCAACTGTTACCCTTATGATGTGCCGGATTATGCCTCCCTTAGGTCACTAGTTGCCTCATCAGGCACCCTGGAGTTTATCAATGAAGACTTCAATTGGACTGGAGTCGCTCAGAGTGGGGAAAGCTATGCTTGCAAAAGGGGATCTGTTAAAAGTTTCTTTAGTAGATTGAATTGGTTGCACGAATCAGAATACAAATATCCAGCGCTGAACGTGACTATGCCAAACAATGGCAAATTTGACAAATTGTACATTTGGGGGGTTCACCACCCGAGCACGGACAGAGAACAAACCAGCCTATATGTTCGAGCATCAGGGAGAGTCACAGTCTCTACCAAAAGAAGCCAACAAACTGTAATCCCGAATATCGGGTCTAGACCCTGGGTAAGGGGTCTGTCCAGTAGAATAAGCATCTATTGGACAATAGTAAAACCGGGAGACATACTTTTGATTAATAGCACCGGGAACCTAATTGCTCCTCGGGGTTACTTCAAAATACGAACTGGGAAAAGCTCAATAATGAGGTCAGATGCACCCATTGGCACCTGCAGTTCTGAATGCATCACTCCAAATGGAAGCATCCCCAATGACAAACCTTTTCAAAATGTAAACAGGATCACATATGGGGCATGTCCCAGATATGTTAAGCAAAACACTCTGAAATTGGCAACAGGGATGCGGAATGTACCAGAGAAACAAACTAGA
>Sample3|Human|H3N2|HA
CAAAAACTTCCCGGAAATGACAACAGCACAGCAACGCTGTGCCTGGGACACCATGCAGTGCCAAACGGAACGCTAGTGAAAACAATCACGAATGATCAAATTGAAGTGACTAATGCTACTGAGCTGGTTCAGAGTTCCTCAACAGGTAGAATATGCAACAGTCCTCACCGAATCCTTGATGGAAAAAACTGCACACTGATAGATGCTCTATTGGGAGACCCTCATTGTGATGGCTTCCAAAATAAGGAATGGGACCTTTTTGTTGAACGCAGCAAAGCTTACAGCAACTGTTACCCTTATGATGTGCCGGATTATGCCTCCCTTAGGTCACTAGTTGCCTCATCAGGCACCCTGGAGTTTACCAATGAAGGCTTCAATTGGACTGGAGTCGCTCAGGATGGGAAAAGCTATGCTTGCAAAAGGGGATCTGTTAACAGTTTCTTTAGTAGATTGAATTGGTTGCACAAATTAGAATACAAATATCCAGCACTGAACGTGACTATGCCAAACAATGACAAATTTGACAAATTGTACATTTGGGGGGTTCACCACCCGAGCACGGACAGTGACCAAACCAGCCTATATGTTCAAGCATCAGGGAGAGTCACAGTCTCTACCAAAAAGAGCCAACAAACTGTAATCCCGAACATCGGGTCTAGACCCTGGGTAAGGGGTATCTCCAGTAGAATAAGCATCTATTGGACAATAGTAAAACCGGGAGACATACTTTTGATTAACAGCACAGGGAATCTAATTGCTCCTCGAGGTTACTTCAAAATACGAAATGGGAAAAGCTCAATAATGAGATCAGATGCACCCATTGACAACTGCAATTCTGAATGCATCACTCCAAATGGAAGCATTCCCAATGACAAACCTTTTCAAAATGTAAACAGGATCACATATGGGGCCTGTCCCAGATATGTTAAGCAAAACACTCTGAAGTTGGCAACAGGGATGCGGAATGTACCAGAGAAACAAACTAGA